Программа конференции NGS-2018

Скачать программу (.pdf, 438 Kb)

Конференция состоится 17 мая 2018 года.

Начало регистрации в 9:00.
Начало конференции в 10:00.
Большой зал ИБХ РАН

Доклады разработчиков и поставщиков аппаратуры
10:00 – 11:00

  1. Современные системы Thermo Fisher Scientific для высокопроизводительного генетического анализа. Евгения Юдина. Thermo Fisher Scientific.
  2. Комплексные решения Roche для приготовления и обогащения библиотек в NGS. Мария Преснякова. Рош Диагностика Рус
  3. Нанопоровое секвенирование Oxford Nanopore. Кристина Яковлева. Диаэм.
  4. Секвенирование генома Cristatella mucedo, опыт использования секвенатора MinION. Виктор Старунов. Санкт-Петербургский Государственный Университет.
  5. Новые возможности NGS: 10Х - новый подход к решению научных задач. Александр Мазур. Геноаналитика.

Кофе-брейк
11:10 – 11:30

Применение высокопроизводительного секвенирования в медицинской практике
11:30 – 12:40

  1. Towards detection of diagnostic microRNA biomarkers in biofluids and the functional analysis of long non-coding RNA using LNA technology. Michael Hansen. QIAGEN.
  2. Анализ мутационного статуса генов, участвующих в патогенезе колоректального рака, методом NGS. Екатерина Телышева. Научный центр рентгенорадиологии Минздрава России.
  3. Использование высокопроизводительного секвенирование при оценке чувствительности к тамоксифену клеточных линий рака молочной железы MCF-7, MCF-7/М, MCF-7/Т. Вера Сафронова. НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина Минздрава России.
  4. Результаты применения неинвазивных пренатальных тестов в клинической практике. Валентина Гнетецкая. Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования.

Кофе-брейк
12:40 – 13:00

Секвенирование геномов прокариот и метагеномное секвенирование
13:00 – 14:20

  1. Геномный анализ некультивируемых микроорганизмов – представителей бактериальных филумов Microgenomates и BRC1. Виталий Кадников. Институт биоинженерии, ФИЦ Биотехнологии РАН.
  2. Design of genus-specific primers panel for detection and identification of viral DNA in environmental samples using next-generation sequencing. Камиль Хафизов. Central Research Institute of Epidemiology.
  3. Chlamydia psittaci эпидемического генотипа 24. Условия для эволюции. Наталья Шарапова. НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи Минздрава России.
  4. Cеквенирование генома болотного планктомицета Paludisphaera borealis PX4 и анализ его гликолитического потенциала. Даниил Наумов. Институт микробиологии им. С.Н.Виноградского РАН.

Обед
14:20 – 15:00

Секвенирование геномов и транскриптомов эукариот, стратегии анализа данных масштабного секвенирования для различных приложений
15:00 – 15:45

  1. Analysis of local chromatin rearrangements during spermatogenesis in Drosophila. Маргарита Самборская. Faculty of Bioengineering and Bioinformatics, Moscow State University.
  2. Zenome Platform - блокчейн-инфраструктура для хранения и обработки генетических данных. Николай Кулемин. Zenome.io LTD.
  3. Сравнение методов квантификации библиотек фрагментов ДНК перед целевым обогащением и секвенированием следующего поколения. Анна Красненко. Генотек.

Кофе-брейк
16:00 – 16:20

Системы редактирования генома и ферменты CRISPR/Cas
16:20 – 17:40

  1. Структура, функции и использование CRISPR-Сas систем у лактобацилл. Елена Полуэктова. Институт общей генетики им.Н.И.Вавилова РАН.
  2. CRISPR-Сas системы Mусоbacterium tuberculosis: структура модуля, возможная роль, изменение в процессе эволюции у различных линий. Марина Зайчикова.
  3. Phenotype and genotype characterization of Usher syndrome in Russian cohort for inclusion in gene therapy trial. Марианна Иванова. Oftalmic LLC.
  4. Оценка эффективности внесения делеции CCR5delta32 методом CRISPR/Cas9 в S-фазе зиготы человека. Денис Ребриков. Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова.
Малый зал ИБХ РАН

Круглый стол «Laboratory Developed Tests (LDT) в России»
14:00 - 15:00

Ежегодный круглый стол «Возможности использования клинико-диагностическими лабораториями изделий, не зарегистрированных как медицинские. Создание формата Laboratory Developed Tests (LDT) в России». Рассмотрение произошедшего за год, планы на следующий.

Сателлитный симпозиум QIAGEN
15:00 - 18:00

  • 15:00 - 15:05 Приветственное слово. Алексей Апчелимов. Директор ООО Кайджен РУС, Москва.
  • 15:05 - 15:35 Targeted RNA and DNA sequencing in disease prediction using QIAseq tools. Michael Hansen. Technical Sales Specialist, Senior Scientist, QIAGEN.
  • 15:35 - 16:05 QIAGEN Sample to Insight NGS solutions for the clinical laboratory: The GeneReader system. Erik Soderback. Director Market Development, Clinical and Applied Genomics, QIAGEN.
  • 16:05 - 16:20 Кофе-брейк 15 минут.
  • 16:20 - 16:40 Использование высокопроизводительного секвенирования при генетическом скрининге. Людмила Любченко. Заведующая лабораторией клинической онкогенетики РОНЦ им. Н.Н. Блохина, д.м.н.
  • 16:40 - 17:00 Клинический случай валидации соматической мутации в гене EGFR у пациента с немелкоклеточным раком легкого. Вера Сафронова. Научный сотрудник лаборатории клинической онкогенетики РОНЦ им. Н.Н. Блохина.
  • 17:00 - 17:20 Новые разработки QIAGEN в жидкостной биопсии и пиросеквенировании. Алексей Аникаев. Специалист по продукции QIAGEN, директор по продажам ООО «Медком», Москва.
  • 17:20 - 17:50 QIAGEN Bioinformatics Solutions for Shotgun Metagenomics. Erik Soderback. Director Market Development, Clinical and Applied Genomics, QIAGEN.
  • 17:50 - 18:00 Подведение итогов и заключительное слово.