Регистрация на школу завершена.

Команда Школы

17 мая 2017 года (за день до конференции NGS-2017) в библиотеке ИБХ РАН (Москва, Миклухо-Маклая 16/10) пройдёт Школа по биоинформатике. Целевая аудитория: студенты профильных вузов и аспиранты.

Школа будет посвящена работе с данными секвенирования нового поколения, а именно анализу данных метагеномного секвенирования (shotgun metagenomic sequencing). В настоящее производится все большее количество полногеномных метагеномных исследований, в тоже время такой тип данных остается новым для большого количества исследователей. Мы покажем основные приемы для работы с такими данными, а также некоторые наши разработки, позволяющие проводить углубленный анализ.

Опытные биоинформатики поделятся хитростями обработки данных начиная с работы с самыми «сырыми» данными, полученными с секвенатора и заканчивая высокоуровневым анализом медицинской или биологической значимости наблюдаемых явлений. Школа будет состоять из лекций и самостоятельных задач, решаемых на собственном компьютере (желательно) или вместе с преподавателями на демонстрационном оборудовании. Основными нашими инструментами будут Linux, bash, R и набор специализированных утилит.

По окончании Школы участник будет иметь широкое представление об основных подходах и методах в анализе данных полногеномного метагеномного секвенирования. Самостоятельное решение задач позволит студенту самому судить о применимости различных решений к специфическим биологическим и медицинским задачам. Поскольку число участников ограничено (максимум 50 человек), в случае большего числа заявок организаторы проведут отбор участников. Для регистрации на Школу необходимо сперва зарегистрироваться на NGS-2017 (бесплатно).

Предварительная программа школы:

  1. Полногеномное метагеномное секвенирование, возможности метода: таксономический и функциональный анализ микробных сообществ, геномы некультивируемых микробов.
  2. Анализ генного окружения как способ поиска горизонтального переноса в микробных сообществах и определения организмов - носителей функционально важных генов.
  3. Таинственный мир бактериальных вирусов: сколько их, кто они, какую роль играют в микробных сообществах. Метавиромный анализ.